Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms