Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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