Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SF1Q15637 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SF1Q15637 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SF1Q15637 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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