Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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