Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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