Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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