Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20Q15388 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms