Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF1Q15361 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
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