Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms