Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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