Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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