Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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