Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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