Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCOLCEQ15113 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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