Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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NCF4Q15080 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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NCF4Q15080 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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