Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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