Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDC1Q14676 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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