Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms