Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTK2BQ14289 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTK2BQ14289 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms