Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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