Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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