Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms