Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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