Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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