Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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