Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOFQ13790 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOFQ13790 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOFQ13790 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
APOFQ13790 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms