Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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