Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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PMS2P11Q13670 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PMS2P11Q13670 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PMS2P11Q13670 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P11Q13670 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms