Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
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