Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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