Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
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