Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R1AQ13522 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms