Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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