Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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