Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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