Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GPS1Q13098 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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GPS1Q13098 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GPS1Q13098 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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