Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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