Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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