Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RAB40BQ12829 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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