Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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