Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 STH1YIL126W 4080 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 CBF2YGR140W 2871 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 OSW7YFR039C 1533 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 MDM32YOR147W 1869 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 HSC82YMR186W 2118 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 SHE9YDR393W 1371 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 PES4YFR023W 1836 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 MXR1YER042W 555 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 YPS5YGL259W 498 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 TWF1YGR080W 999 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 RAM2YKL019W 951 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 AIM32YML050W 936 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC39Q12745 SMB1YER029C 591 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 AAD16YFL057C 459 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 ATP15YPL271W 189 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PDR11YIL013C 4236 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SSY1YDR160W 2559 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 TIM9YEL020W-A 264 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 COX13YGL191W 390 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YHR130CYHR130C 336 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 TIM8YJR135W-A 264 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 UTP30YKR060W 825 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PAU8YAL068C 363 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 LCL2YLR104W 396 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 NOP15YNL110C 663 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PAU20YOL161C 363 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 MGR1YCL044C 1254 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 BNI1YNL271C 5862 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 BRO1YPL084W 2535 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 TAE2YPL009C 3117 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 NUP100YKL068W 2880 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 RVS161YCR009C 798 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 BNA7YDR428C 786 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 GET1YGL020C 708 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YLR458WYLR458W 381 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 IGO1YNL157W 507 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YOR105WYOR105W 327 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 VPS16YPL045W 2397 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SAP185YJL098W 3177 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 NOP14YDL148C 2433 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YCR001WYCR001W 315 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SDC1YDR469W 528 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 RPL40AYIL148W 387 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PAU14YIL176C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PAU1YJL223C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YJR079WYJR079W 330 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 RMP1YLR145W 606 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 ICY1YMR195W 384 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SPC29YPL124W 762 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 ASM4YDL088C 1587 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SPE1YKL184W 1401 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 INP53YOR109W 3324 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SNU114YKL173W 3027 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 BIG1YHR101C 1008 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YOR050CYOR050C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 DGK1YOR311C 873 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YBR277CYBR277C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SSD1YDR293C 3753 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 PRK1YIL095W 2433 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 RPI1YIL119C 1224 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YKL111CYKL111C 336 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YLR031WYLR031W 561 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YLR171WYLR171W 390 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SYM1YLR251W 594 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YLR379WYLR379W 375 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 EDS1YBR033W 2760 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SPP41YDR464W 4308 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 GUP1YGL084C 1683 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 SCP160YJL080C 3669 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 AFI1YOR129C 2682 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 YCR064CYCR064C 411 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 BI2Q0110 1272 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 TOM22YNL131W 459 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC39Q12745 UBP11YKR098C 2154 nt2.34□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 REV1YOR346W 2958 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SHE2YKL130C 741 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RPS17AYML024W 411 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YEL043WYEL043W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 KAP123YER110C 3342 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SIR4YDR227W 4077 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 PTC5YOR090C 1719 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 VTC1YER072W 390 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YFR056CYFR056C 369 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RPC10YHR143W-A 213 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YJL007CYJL007C 315 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 AIM29YKR074W 468 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 LSM7YNL147W 348 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 NUP82YJL061W 2142 nt2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms