Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 HMI1YOL095C 2121 nt1.26□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 PET20YPL159C 762 nt1.26□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 TRS20YBR254C 528 nt1.26□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 FRK1YPL141C 2598 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 NOP53YPL146C 1368 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 SDL1YIL167W 633 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 BUD19YJL188C 309 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YJR023CYJR023C 402 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YML003WYML003W 873 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 CUR1YPR158W 759 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 HIR3YJR140C 4947 nt1.25□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 RTT102YGR275W 474 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YAR068WYAR068W 486 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YLR458WYLR458W 381 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 RPN8YOR261C 1017 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YPR147CYPR147C 915 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 snR24snR24 89 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 BST1YFL025C 3090 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 IML1YJR138W 4755 nt1.24□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 PRS3YHL011C 963 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 RPL40AYIL148W 387 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 HYR1YIR037W 492 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 PSF2YJL072C 642 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YBR051WYBR051W 351 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 RRP15YPR143W 753 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 FYV8YGR196C 2454 nt1.23□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 COX1Q0045 1605 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YDR336WYDR336W 945 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YER121WYER121W 345 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 TAP42YMR028W 1101 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 ATG16YMR159C 453 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 SFG1YOR315W 1041 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 APM3YBR288C 1452 nt1.22□□□□□ -2.21
PEX11Q12462 ASM4YDL088C 1587 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 TTI1YKL033W 3117 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 HTD2YHR067W 843 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 MCM22YJR135C 720 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YOL162WYOL162W 648 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 PIP2YOR363C 2991 nt1.21□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 FYV6YNL133C 522 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 RPL33BYOR234C 324 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 MGR1YCL044C 1254 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 MAD1YGL086W 2250 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 TRM732YMR259C 4263 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SEC21YNL287W 2808 nt1.2□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 IRE1YHR079C 3348 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 KAP122YGL016W 3246 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YIP1YGR172C 747 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YOL150CYOL150C 312 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YSW1YBR148W 1830 nt1.19□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 HSK3YKL138C-A 210 nt1.18□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YOR366WYOR366W 354 nt1.18□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SIP4YJL089W 2490 nt1.18□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 MSN5YDR335W 3675 nt1.18□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SPO75YLL005C 2607 nt1.18□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 LST4YKL176C 2487 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 ZRG8YER033C 3231 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 TSA2YDR453C 591 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SNO3YFL060C 669 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 ARG3YJL088W 1017 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 GRX8YLR364W 330 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 MTG1YMR097C 1104 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SNO2YNL334C 669 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 VMR1YHL035C 4779 nt1.17□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SHS1YDL225W 1656 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 YIL082WYIL082W 873 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 CMC2YBL059C-A 330 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 snR44snR44 211 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 EST2YLR318W 2655 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 DAS1YJL149W 1992 nt1.16□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 CTR9YOL145C 3234 nt1.15□□□□□ -2.22
PEX11Q12462 SLU7YDR088C 1149 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 YGL204CYGL204C 306 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 STF2YGR008C 255 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 YGR242WYGR242W 309 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 ATP18YML081C-A 180 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 NDD1YOR372C 1665 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 RSM22YKL155C 1887 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 MAK10YEL053C 2202 nt1.15□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 NCA2YPR155C 1851 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 SPT14YPL175W 1359 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 HUG1YML058W-A 207 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 PGA1YNL158W 597 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 PEX27YOR193W 1131 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 TYE7YOR344C 876 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 EGD1YPL037C 474 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 AHC1YOR023C 1701 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 CDC27YBL084C 2277 nt1.14□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 MLH3YPL164C 2148 nt1.13□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 ALK1YGL021W 2283 nt1.13□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt1.13□□□□□ -2.23
PEX11Q12462 IST3YIR005W 447 nt1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms