Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YPL216WYPL216W 3309 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 GEA1YJR031C 4227 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 ATP17YDR377W 306 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 NOP19YGR251W 591 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 RPL14BYHL001W 417 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 RPB11YOL005C 363 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 TIM18YOR297C 579 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 EGD1YPL037C 474 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 SLM6YBR266C 453 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 GCD10YNL062C 1437 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 KIN82YCR091W 2163 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 APC2YLR127C 2562 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YJR003CYJR003C 1560 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 RPL37AYLR185W 267 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 snR191snR191 274 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YPR203WYPR203W 309 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YLR001CYLR001C 2589 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 JIP5YPR169W 1479 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 SIN3YOL004W 4611 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 DBP10YDL031W 2988 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YLR278CYLR278C 4026 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 TAO3YIL129C 7131 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 snR65snR65 100 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YKL111CYKL111C 336 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 ATP3YBR039W 936 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 SNX41YDR425W 1878 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 MDM32YOR147W 1869 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 INP52YNL106C 3552 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YHR078WYHR078W 1659 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 SPB1YCL054W 2526 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YDR102CYDR102C 333 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YFL032WYFL032W 321 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 NAB3YPL190C 2409 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 JSN1YJR091C 3276 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 FUS1YCL027W 1539 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 TIM8YJR135W-A 264 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 PRE8YML092C 753 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 MRPL33YMR286W 261 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 CAF120YNL278W 3183 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 SKT5YBL061C 2091 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YBT1YLL048C 4986 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YEL057CYEL057C 702 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 AAD16YFL057C 459 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YMR31YFR049W 372 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YJL202CYJL202C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YAR029WYAR029W 225 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YPL238CYPL238C 390 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX3Q12229 snR8snR8 190 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 TIF35YDR429C 825 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 RPS22BYLR367W 393 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 RPS12YOR369C 432 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 VPS64YDR200C 1815 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 OST1YJL002C 1431 nt2.58□□□□□ -2
UBX3Q12229 RSE1YML049C 4086 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 RLI1YDR091C 1827 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 TSA2YDR453C 591 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 URM1YIL008W 300 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 ISU1YPL135W 498 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 ATP15YPL271W 189 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 snR36snR36 182 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 DNL4YOR005C 2835 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 NDD1YOR372C 1665 nt2.57□□□□□ -2
UBX3Q12229 HMRA2YCR096C 360 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 MSL1YIR009W 336 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 GPI14YJR013W 1212 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 COX7YMR256C 183 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 FPR1YNL135C 345 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 BIL1YOR304C-A 231 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 SUL1YBR294W 2580 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 BNA4YBL098W 1383 nt2.56□□□□□ -2
UBX3Q12229 BCK1YJL095W 4437 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 PAU14YIL176C 363 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 PAU1YJL223C 363 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 YSW1YBR148W 1830 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 TOP2YNL088W 4287 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 IKI3YLR384C 4050 nt2.55□□□□□ -2
UBX3Q12229 RLF2YPR018W 1821 nt2.54□□□□□ -2
UBX3Q12229 CAJ1YER048C 1176 nt2.54□□□□□ -2
UBX3Q12229 AIM32YML050W 936 nt2.54□□□□□ -2
UBX3Q12229 COG3YER157W 2406 nt2.54□□□□□ -2
UBX3Q12229 YNL034WYNL034W 1839 nt2.54□□□□□ -2
UBX3Q12229 COX1Q0045 1605 nt2.53□□□□□ -2
UBX3Q12229 snR76snR76 109 nt2.53□□□□□ -2
UBX3Q12229 CRS5YOR031W 210 nt2.53□□□□□ -2
UBX3Q12229 SEC26YDR238C 2922 nt2.53□□□□□ -2
UBX3Q12229 SKP2YNL311C 2292 nt2.53□□□□□ -2
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