Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 SRN2YLR119W 642 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 MNE1YOR350C 1992 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 PAF1YBR279W 1338 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 ATP16YDL004W 483 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 AIM6YDL237W 1173 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 MRP49YKL167C 414 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 ESA1YOR244W 1338 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 SRL1YOR247W 633 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YER189WYER189W 369 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 ALG5YPL227C 1005 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CET1YPL228W 1650 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 LTP1YPR073C 486 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CRM1YGR218W 3255 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CDC27YBL084C 2277 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 KAP122YGL016W 3246 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 PHO92YDR374C 921 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YEA4YEL004W 1029 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CIC1YHR052W 1131 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YLR169WYLR169W 354 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YMR181CYMR181C 465 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 TOA1YOR194C 861 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YBR277CYBR277C 402 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 YNL034WYNL034W 1839 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 BIT61YJL058C 1632 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 COG8YML071C 1824 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SLF1YDR515W 1344 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 NYV1YLR093C 762 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YMR099CYMR099C 894 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YOR152CYOR152C 771 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 RXT2YBR095C 1293 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 CTR9YOL145C 3234 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 ATG10YLL042C 504 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 PES4YFR023W 1836 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YAP3YHL009C 993 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 CDC50YCR094W 1176 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 DIG2YDR480W 972 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SPO12YHR152W 522 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 MUB1YMR100W 1863 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 ASI3YNL008C 2031 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 LTO1YNL260C 597 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 NGL1YOL042W 1092 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 MUM3YOR298W 1440 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YDR338CYDR338C 2088 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 ARK1YNL020C 1917 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SPO77YLR341W 1434 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SHU2YDR078C 672 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 COBQ0105 1158 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YIL161WYIL161W 708 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YBR032WYBR032W 303 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SLK19YOR195W 2466 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 NOP53YPL146C 1368 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 JJJ2YJL162C 1752 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 RLM1YPL089C 2031 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 CHC1YGL206C 4962 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 TEN1YLR010C 483 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 PRM6YML047C 1059 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 ECM11YDR446W 909 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 YAR068WYAR068W 486 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 BET5YML077W 480 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SRL4YPL033C 846 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BRQ12193 SAS3YBL052C 2496 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 SPC1YJR010C-A 285 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 ATG38YLR211C 681 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 PRP39YML046W 1890 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 TAN1YGL232W 870 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 BNS1YGR230W 414 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YLR290CYLR290C 834 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 snR14snR14 160 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YPR063CYPR063C 423 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 BTN2YGR142W 1233 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 PFK27YOL136C 1194 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 WHI3YNL197C 1986 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 SEC8YPR055W 3198 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 GIM3YNL153C 390 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 NSL1YPL233W 651 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 IES5YER092W 378 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 VPS55YJR044C 423 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 SRP21YKL122C 504 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YNR068CYNR068C 819 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 CSI2YOL007C 1026 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 CUR1YPR158W 759 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 ASM4YDL088C 1587 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 DSE2YHR143W 978 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 PET123YOR158W 957 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 MTC7YEL033W 420 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 MUK1YPL070W 1839 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 RRG1YDR065W 1098 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 KAR9YPL269W 1935 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-BRQ12193 YCR108CYCR108C 192 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YHR022CYHR022C 771 nt0.59□□□□□ -2.32
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