Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 DNL4YOR005C 2835 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YJL181WYJL181W 1836 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 AAD16YFL057C 459 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 CCW14YLR390W-A 717 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 CGI121YML036W 546 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RGM1YMR182C 636 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 COX7YMR256C 183 nt3.37□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 SPO71YDR104C 3738 nt3.36□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 COX14YML129C 213 nt3.36□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YJR098CYJR098C 1971 nt3.36□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 ILS1YBL076C 3219 nt3.36□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 KSP1YHR082C 3090 nt3.35□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.35□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL25YOL127W 429 nt3.35□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RCY1YJL204C 2523 nt3.35□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 DUG2YBR281C 2637 nt3.35□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 POL2YNL262W 6669 nt3.34□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL40AYIL148W 387 nt3.34□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YKL118WYKL118W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 TCB2YNL087W 3537 nt3.34□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 ORC1YML065W 2745 nt3.34□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 IRC10YOL015W 1761 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 ASG1YIL130W 2895 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 USE1YGL098W 738 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 RPS18BYML026C 441 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YNL010WYNL010W 726 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YPL225WYPL225W 441 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 GCV2YMR189W 3105 nt3.33□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 snR79snR79 84 nt3.32□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 PAU14YIL176C 363 nt3.32□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 PAU1YJL223C 363 nt3.32□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 BIL1YOR304C-A 231 nt3.32□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 PMR1YGL167C 2853 nt3.32□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 RRM3YHR031C 2172 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 SSN2YDR443C 4263 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 ABM1YJR108W 372 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 MRPL31YKL138C 396 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YLR031WYLR031W 561 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 RPL9BYNL067W 576 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 RPS12YOR369C 432 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 RPL33AYPL143W 324 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YPR089WYPR089W 2667 nt3.31□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YHR078WYHR078W 1659 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 GCD6YDR211W 2139 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 MZM1YDR493W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 ERP6YGL002W 651 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 TMA22YJR014W 597 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 COQ10YOL008W 624 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YBL108WYBL108W 306 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 ROX1YPR065W 1107 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 FIR1YER032W 2631 nt3.3□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 DOA4YDR069C 2781 nt3.29□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.29□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 ATP3YBR039W 936 nt3.29□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 VPS41YDR080W 2979 nt3.29□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 NAN1YPL126W 2691 nt3.28□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 CDC50YCR094W 1176 nt3.28□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.28□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YAR053WYAR053W 297 nt3.28□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 YPL182CYPL182C 384 nt3.28□□□□□ -1.88
SSF2Q12153 FUN30YAL019W 3396 nt3.28□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 MSL1YIR009W 336 nt3.27□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YBL065WYBL065W 345 nt3.27□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 FPR1YNL135C 345 nt3.27□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 CRS5YOR031W 210 nt3.27□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 CDC24YAL041W 2565 nt3.26□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 GIN4YDR507C 3429 nt3.26□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 REV1YOR346W 2958 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 PRP6YBR055C 2700 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YDL011CYDL011C 324 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YER121WYER121W 345 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YER181CYER181C 324 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YKR033CYKR033C 426 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 UTP30YKR060W 825 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 FCF2YLR051C 654 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 DYN1YKR054C 12279 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 UTP14YML093W 2700 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 BPT1YLL015W 4680 nt3.25□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 PTC5YOR090C 1719 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 VPS64YDR200C 1815 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YJL070CYJL070C 2667 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 TAO3YIL129C 7131 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 SNQ2YDR011W 4506 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YHL037CYHL037C 402 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 MAM33YIL070C 801 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YPR146CYPR146C 330 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 NCL1YBL024W 2055 nt3.24□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.23□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YDL152WYDL152W 366 nt3.23□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 SDC25YLL016W 3147 nt3.23□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 SNU114YKL173W 3027 nt3.22□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 UBP11YKR098C 2154 nt3.22□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YFR056CYFR056C 369 nt3.22□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.22□□□□□ -1.89
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