Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 NYV1YLR093C 762 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 HMI1YOL095C 2121 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YBR277CYBR277C 402 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YLR169WYLR169W 354 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 PUS9YDL036C 1389 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 TOA1YOR194C 861 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 snR14snR14 160 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 RXT2YBR095C 1293 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 CRM1YGR218W 3255 nt0.63□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 CTL1YMR180C 963 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 ACA1YER045C 1470 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 RLM1YPL089C 2031 nt0.62□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 SHU2YDR078C 672 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YMR181CYMR181C 465 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YOR203WYOR203W 354 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YDR132CYDR132C 1488 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 CTR9YOL145C 3234 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 RMD5YDR255C 1266 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YGR190CYGR190C 366 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YAP3YHL009C 993 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 ATG10YLL042C 504 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 LST4YKL176C 2487 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YNL034WYNL034W 1839 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 PES4YFR023W 1836 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 MRP49YKL167C 414 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 CLB5YPR120C 1308 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 SAS3YBL052C 2496 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 APC5YOR249C 2058 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YEA4YEL004W 1029 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YGR064WYGR064W 369 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 TEN1YLR010C 483 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 ATG38YLR211C 681 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YOR152CYOR152C 771 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 LTP1YPR073C 486 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 SLK19YOR195W 2466 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 DIG2YDR480W 972 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 CUP9YPL177C 921 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 ARK1YNL020C 1917 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 MRPL25YGR076C 474 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 SPC42YKL042W 1092 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 NOP53YPL146C 1368 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 BTN2YGR142W 1233 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 SPC1YJR010C-A 285 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 KAR9YPL269W 1935 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 CUR1YPR158W 759 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YSW1YBR148W 1830 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 IES5YER092W 378 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YIL161WYIL161W 708 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 VPS55YJR044C 423 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YAR068WYAR068W 486 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 NGL1YOL042W 1092 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 ASM4YDL088C 1587 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 SEC8YPR055W 3198 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 MTC7YEL033W 420 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 NSL1YPL233W 651 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YPR063CYPR063C 423 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 COG8YML071C 1824 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 CET1YPL228W 1650 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 PRP39YML046W 1890 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 PET123YOR158W 957 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 SNC2YOR327C 348 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-LR1Q12088 NSE4YDL105W 1209 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 CSI2YOL007C 1026 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 WHI3YNL197C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 NSE3YDR288W 912 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 JJJ2YJL162C 1752 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 EPT1YHR123W 1176 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YJL022WYJL022W 309 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 GIM3YNL153C 390 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YNR068CYNR068C 819 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 SRL4YPL033C 846 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YGL177WYGL177W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 COX1Q0045 1605 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 PRM6YML047C 1059 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YMR099CYMR099C 894 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YBL077WYBL077W 432 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 MUB1YMR100W 1863 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YCR108CYCR108C 192 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 CSE1YGL238W 2883 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 SRP21YKL122C 504 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YBR063CYBR063C 1215 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YDR338CYDR338C 2088 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 CDC27YBL084C 2277 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 AZF1YOR113W 2745 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 RPL40AYIL148W 387 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YNL179CYNL179C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 snR191snR191 274 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 MUK1YPL070W 1839 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-LR1Q12088 PHO92YDR374C 921 nt0.46□□□□□ -2.34
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