Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP1B1Q10567 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms