Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAAP100Q0VG06 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP100Q0VG06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms