Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms