Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms