Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms